取代基团对倍他环糊精包合的影响

有研究人员通过分子动力学（MD）模拟研究了蒽（ANT）在三种环糊精（即倍他环糊精、羟丙基倍他环糊精和磺丁基倍他环糊精）中的包合行为。MD结果表明，ANT可以自发地进入这三种环糊精的空腔中。不同的是，与磺丁基倍他环糊精进行包合作用时，ANT只能从磺丁基倍他环糊精的宽边进入其空腔。然后，通过分析每种环糊精的葡萄糖单元的结构畸变，研究了取代基2-羟基丙基（HP）和磺化丁基（SBE）对环糊精结构的影响。

  结果发现，中性的倍他环糊精呈现出圆锥形结构，而HP或SBE基团的存在对结构的影响很大。由于取代基团的波动引起的葡萄糖单元的翻转，二级边缘会变窄。当ANT被包含在空腔内时，三个环糊精的空腔构象得到了一定程度的恢复。同时，取代基团沿空腔轴线延伸并与客体分子相互作用。

  通过分析每个环糊精和ANT之间的相互作用，发现取代基团扩大了疏水性空腔的体积。取代基团和葡萄糖单元都会对与客体分子的相互作用作出贡献。环糊精环的构象变化导致空腔的收缩，这可能使其与ANT分子紧密结合。